Tutkijatohtori Keliakian Molekulaarisen Patogeneesin tutkimukseen

Tampereen yliopisto ja Tampereen ammattikorkeakoulu muodostavat korkeakouluyhteisön, joka uskoo ihmiseen ja tieteeseen. Tekniikan, terveyden ja yhteiskunnan huippuosaajat muuttavat maailmaa Suomen toiseksi suurimmassa monitieteisessä ja innostavassa tutkimus- ja oppimisympäristössä. www.tuni.fi 

Tutkijatohtori Keliakian Molekulaarisen Patogeneesin tutkimukseen

Suoliston Signaalinvälitys ja Epigenetiikka (ISE) -tutkimusryhmä keskittyy suoliston epiteelin kudostasapainoa ylläpitävien signaalinvälitysmekanismien tutkimiseen. Päätavoitteenamme on ymmärtää keliakian molekyylitason tautimekanismeja ja tunnistaa uusia lääkekohteita terapeuttista käyttöä varten. Teemme tiivistä yhteistyötä kansainvälisten lääkealan yritysten kanssa ja osallistumme aktiivisesti kliinisiin lääketutkimuksiin, joissa arvioidaan uusien hoitomuotojen tehoa keliakiaan. Lisäksi johdamme EU-rahoitteisen ENT1DEP-konsortion työpakettia, jossa kehitämme organoidi- ja solumalleja. Näiden mallien avulla tutkimme, kuinka suolistovirukset voivat altistaa yksilöitä keliakialle ja tyypin 1 diabetekselle.

Etsimme nyt motivoitunutta postdoc tutkijaa liittymään ISE-ryhmään osana Suomen Akatemian rahoittamaa CELIOMICS-tutkimushanketta.

Postdoc tutkija – CELIOMICS-hanke

Etsimme motivoitunutta postdoc tutkijaa liittymään monitieteiseen tutkimusryhmäämme, joka keskittyy keliakian tutkimukseen. Valittu henkilö analysoi ensisijaisesti RNA-sekvensointi- ja muita multiomiikkadatoja, joita tuotetaan CELIOMICS-hankkeessa sekä keliakian lääketutkimuksissa. Työ perustuu discovery science -lähestymistapaan, jossa tavoitteena on tuottaa uusia hypoteeseja monimutkaisista aineistoista.

Keskeiset tehtävät:

• Multiomiikkadatan (esim. RNA-seq, ChIP-seq) integroitu analyysi uusien biologisten ilmiöiden tunnistamiseksi.
• Osallistuminen keliakiapotilaista kerättävän suolisto-organoidibiopankin perustamiseen Tampereen alueella.
• Laboratoriotyön toteuttaminen ja ohjaaminen, mukaan lukien:
  • Organoidien käsittely lääkeaihioilla.
  • Organoidien infektointi suolistoviruksilla.
  • Geeniekspression ja epigeneettisten muutosten analysointi edistyneillä sekvensointimenetelmillä.
• Tutkimustulosten ja löydösten raportointi tutkimusryhmän johtajalle (PI)
• Mahdollisuus osallistua myös eläinkokeisiin, joissa käytetään keliakian tautimekanismeja mallintavia transgeenisiä hiiriä.

Tämä tehtävä tarjoaa ainutlaatuisen mahdollisuuden työskennellä laskennallisen biologian, kokeellisen tutkimuksen ja kliinisen soveltamisen rajapinnassa ja edistää uusien hoitomuotojen kehittämistä keliakiaan.

Edellytykset

Etsimme kilpailukykyisiä hakijoita, joilla on vahva näyttö kansainvälisesti korkeatasoisesta molekyylibiologisesta tutkimuksesta.

Hakijalta edellytetään:

• Tohtorintutkinto soveltuvalta alalta, kuten molekyylibiologia, bioinformatiikka, biotekniikka tai muu vastaava.
• Kokemusta RNA-sekvensointi- ja/tai ChIP-seq-analyysistä, mukaan lukien bioinformatiikan työkalujen ja analyysien tuntemus.
• Vahva tausta molekyylibiologian menetelmissä, erityisesti geeniekspression ja epigeneettisen säätelyn analysoinnissa.
• Käytännön kokemusta 3D-soluviljelmistä, kuten suoliorganoideista.
• Tuntemusta multiomiikkadatan integroinnista ja hypoteesien muodostamisesta discovery science -lähestymistavan avulla.
• Erinomainen englannin kielen kirjallinen ja suullinen taito.
• Kyky työskennellä sekä itsenäisesti että osana monitieteistä tutkimusryhmää.

Eduksi katsottavat lisävalmiudet (jotakin näistä):

·Kokemusta biopankki- tai kliinisten näytteiden keruuprojektien koordinoinnista.

·Tuntemusta keliakian biologiasta tai ruoansulatuskanavan immunologiasta.

·Kokemusta suolistovirusten infektiomalleista.

·Tuntemusta transgeenisistä hiirimalleista ja valmius eläinkokeisiin (vaadittavalla pätevyydellä).

·Osaamista R-, Python- tai muista tilastollisista ohjelmointikielistä, joita käytetään omics-datan analyysissä.

·Aiempi kokemus opiskelijoiden tai nuorempien tutkijoiden ohjaamisesta.

Tampereen yliopisto on ainutlaatuinen, monialainen ja rohkeasti tulevaisuuteen katsova, kehittyvä yhteisö. Meille tärkeitä arvoja ovat avoimuus, kriittisyys, moninaisuus, oppijalähtöisyys, rohkeus, sivistys ja vastuullisuus. Toivommekin, että voit osaltasi sitoutua näihin arvoihin ja edistät niiden mukaista toimintaa omassa tehtävässäsi.

Hakuohjeet

Katso yllä olevasta englanninkielisestä ilmoituksesta tarkemmat tiedot tehtävästä sekä hakuohjeet. Hakuaika päättyy 7.9.2025 klo 23:59.